Mit SQL Server 2008 R2 November CTP wird eine Build-Version von SQL Server CE 3.5 SP2 ausgeliefert, die es laut der Microsoft-Website nicht geben dürfte, nämlich 3.5.8050.
Die RTM build versionen können unter http://support.microsoft.com/kb/950550/en-us nachgelesen werden. Die Buildversion, die es als offizielle SQL Server CE 3.5 SP2 Beta 2 zum download gibt, hört auf die Nummer 3.5.8049. Offenbar liegt der SQL Server 2008 R2 November CTP etwas neueres bei.
Leider verweigert der Installer von time cockpit 2010 (Beta 1) den Dienst, wenn der Build 3.5.8050 installiert ist. Die Beta 2 wird darauf Rücksicht nehmen, versprochen!
Vielen Dank @Andi für das Entdecken dieses Fehlers!